Созданный по инициативе и на средства участников Первой обороны Севастополя, он является хранителем истории и воспитателем на традициях флота многих поколений военных моряков-черноморцев.
За почти 150-летний отрезок времени музей прошел все поворотные и судьбоносные этапы в своей судьбе, неразрывно связанной с историей Черноморского флота.
Современная экспозиция музея отражает этапы создания Черноморского флота, его участия в Крымской войне, революционные события начала 20 века, предвоенного строительства флота, героическую оборону и освобождение черноморских городов-героев Одессы, Севастополя, Керчи, Новороссийска в период Великой Отечественной войны, послевоенное создание современного флота и его выход на океанские просторы.
Музей Черноморского флота пользуется большой популярностью среди военнослужащих, жителей и гостей Севастополя, его постоянными посетителями являются юные нахимовцы и школьники, а также участники движения «Юнармия» и дети, отдыхающие в Международном детском центре «Артек».
Ежегодно музей ЧФ посещают порядка 80 тысяч человек.
Коллектив музея с днем рождения поздравил командующий Черноморским флотом, командиры соединений и частей флота, представители исторических клубов и общественных организаций, коллеги из других российских музеев.